以下のガイドライン等が参考になります。

・日本歯周病学会編,　歯周疾患者における抗菌療法の指針,　医歯薬出版,　2011
P.76－81（P.80の「表10」など）
※日本歯周病学会のウェブサイトでも公開されています。
http://www.perio.jp/publication/upload_file/guideline_antimicrobial_therapy.pdf
・Axelsson P: Diagnosis and Risk prediction of dental caries 2; Quintessence Publishing Co, Illinois,151-178,2000

インプラント周囲炎における検査の扱いについては以下が参考になります。
2009　；P.15－16,　P.30－36
http://www.perio.jp/publication/upload_file/guideline_implant.pdf

GC　CIRCLE　No.141　2012-6にも関連記事があります。ご参照ください。
歯周病原細菌検査システム
「サリバチェック ラボ 歯周病原細菌」をインプラント治療に生かす
細菌検査システムの必要性と検査の実際　PDF6ページ（896KB）
辰巳順一：　明海大学歯学部 口腔生物再生医工学講座 歯周病学分野　准教授
申　基喆：　明海大学歯学部 口腔生物再生医工学講座 歯周病学分野　教授

※リンク先